: PAN: métagénomique

métagénomique

Méthode d'analyse globale des génomes d'un échantillon de l'environnement. Cette méthode ne passe pas par la mise en culture et l'isolement de chaque organisme vivant. Il s'agit d'extraire l'ADN d'un échantillon de l'environnement, par exemple d'un levain, et de séquencer l'ensemble des brins d'ADN extrait. L'ADN de l'ensemble des espèces présentes dans l'échantillon est donc extrait et séquencé ensemble. C'est une méthode dite « semi-quantitative » car elle ne permet pas de connaître précisément les proportions de chaque espèce mais donne une idée des espèces dominantes et des espèces moins fréquentes. Elle permet également d'avoir un aperçu de la diversité des gènes d'un écosystème et donc de son potentiel fonctionnel.

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